Institut Ruđer Bošković (Zavod za organsku kemiju i biokemiju)
Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana
PRIRODNE ZNANOSTI Interdisciplinarne prirodne znanosti
Opis (hrvatski)
Dipeptidil peptidaza III (DPP III) je cink-ovisna metalopeptidaza koja uzastopno odcjepljuje dipeptide s amino-kraja 3 do 10 aminokiselina dugih peptida te je široko rasprostranjena u organizmima od bakterija do ljudi. Smatra se da ima ulogu u završnim stadijima proteinskog metabolizma u stanici te u regulaciji krvnog tlaka i boli. DPP III je također uključena u regulaciju Nrf2/KEAP1 signalnog puta kroz kompetitivno vezanje na protein KEAP1 koje dovodi do oslobađanja transkripcijskog faktora Nrf2 i aktivacije odgovora na oksidativni stres. U potrazi za drugim proteinskim interaktorima DPP III, pomoću SILAC-MS metode, identificiran je protein SH2 domain-containing protein 3C (SH2D3C) kao potencijalni interaktor. Interakcija je potvrđena na prekomjerno eksprimiranim proteinima korištenjem nekoliko biokemijskih metoda. SH2D3C je jedan od tri člana proteinske NSP obitelji koji sadrže domenu SH2, RasGEF sličnu domenu te regiju bogatu prolinima i serinima između tih dviju domena. SH2D3C i ostala dva člana porodice (SH2D3A and BCAR3) djeluju kao adaptorski i konstrukcijski proteini koji kontroliraju migraciju stanica integriranjem prijenosa signala preko faktora rasta i integrina, ali precizni način njihovog djelovanja još uvijek je nepoznat. U predloženom istraživanju planiramo potvrditi interakciju na endogenim proteinima, utjecaj svakog od proteina na stanične procese u kojima sudjeluju prekomjernom ekspresijom proteina te izbacivanjem (engl. knock out) gena, odrediti afinitet vezanja pomoću biofizičkih metoda te predvidjeti mjesta vezanja molekulskim modeliranjem. Rezultati predloženog istraživanja omogućit će bolje razumijevanje uloge DPP III u signalnim putevima u koje je uključen SH2D3C i obratno. Imajući u vidu da su kontrola migracije stanica i signalni put Nrf2/KEAP1 često narušeni u raku, rezultati predloženog istraživanja mogli bi otvoriti nove mogućnosti za detekciju biomarkera i liječenje raka.
Šifra: IP-2020-02-6743 Naziv: Interakcija dipeptidil peptidaze III s proteinom SH2 domain-containing protein 3C – moguća veza između odgovora na oksidativni stres i stanične migracije Naziv: Dipeptidyl peptidase III interaction with SH2 domain-containing protein 3C – possible link between oxidative stress response and cell migration Kratica: OxMiLink Voditelj: Mihaela Matovina Pravna nadležnost: Hrvatska Financijer: HRZZ Linija financiranja: IP